这部电影讲述了海上自卫队二尉有动贵文在调查太平洋上不明飞行物体时，意外遭遇蓝光影响，导致遗传因子发生变异，化身为凶恶怪兽THE ONE。与此同时，航空自卫队F15J飞行员真木舜一为了陪伴患病儿子，辞去官职。在最后一次飞行中，真木与一道红光相遇，却奇迹般地生还并开始新生活。然而，他却被特殊机关BCST强制带走并在废工厂进行监视。水原沙罗等人对真木展开了调查，而失踪的怪兽THE ONE也令局势变得更加扑朔迷离。这部电影将科幻元素与人物情感紧紧相扣，展现了人类与怪兽之间错综复杂的联系。角色命运的交织与转变让整个故事充满了悬念与紧张感，同时也探讨了人类基因与自我意识的边界。影片通过独特的视角和精彩的剧情，呈现出一场令人不可思议又深思的科幻冒险。